DS409 ma procesor 1,2 GHz, 256 MB pamięci RAM DDR2, port sieciowy Gigabit LAN, dwa złącza USB 2.0 i jedno eSATA. Możliwość obsługi dysków twardych o pojemności do 2 TB sprawia, że urządzenie pomieści łącznie do 8 TB danych w trybie RAID 0 lub w systemie JBOD. W konstrukcji DS409 zminimalizowana została liczba użytych przewodów połączeniowych, co przekłada się na łatwą instalację dysków i większą stabilność systemu.

Wbudowany w DS409 uchwyt na dyski obsługuje zarówno modele 3,5", jak i 2,5". W przypadku korzystania z dysków 2,5", podczas codziennej pracy urządzenia wentylator odpowiedzialny za chłodzenie pozostaje wyłączony. Gdy temperatura wzrośnie, wentylator uruchamia się z małymi obrotami, co zmniejsza zużycie energii i minimalizuje wibracje, a w rezultacie nie naraża zainstalowanych dysków twardych na wstrząsy oraz wydłuża ich czas bezawaryjnej pracy.

Oprogramowanie sterujące Disk Station Manager 2.1 współpracuje z różnymi systemami operacyjnymi, zapewnia integrację z Windows ADS, monitoring wideo i wygodną obsługę plików, a także udostępnia zaawansowany serwer FTP i serwer poczty elektronicznej. Różne metody wykonywania kopii zapasowej, w tym Encrypted Network Backup (sieciowy i szyfrowany), Local Backup (lokalny), Desktop Backup (z komputera), a także opcje RAID 1/5/6, chronią cenne dla każdego użytkownika dane.

Przygotowywany przez Synology system Disk Station Manager 2.2, który w wersji beta ukaże się w lipcu, a w wersji finalnej we wrześniu bieżącego roku, udostępni dodatkowe funkcje odpowiedzialne za bezpieczeństwo i backup. Wbudowana zapora sieciowa ma zapewniać możliwość ustalania reguł bezpieczeństwa, a użytkownicy komputerów Mac będą mogli korzystać z Apple Time Machine, jako aplikacji zapewniającej kopię bezpieczeństwa danych na serwerze DS409.

Z testów przeprowadzonych przez producenta wynika, że w konfiguracji RAID 5, model DS409 osiąga prędkość 34 MB/s podczas wysyłania w systemie Windows, a dpobierania 47 MB/s.

Podczas pracy urządzenie pobiera niecałe 43 W. Produkt wyceniono na 1840 złotych netto (cena sugerowana).